Dataset related to article: "Calpain-1 and calpain-2 promote breast cancer metastasis"
Notice bibliographique
Résumé
This dataset accompanies the manuscript “Calpain-1 and calpain-2 promote breast cancer metastasis” and contains raw image data underlying the in vivo tumor biology and metastasis figures (Fig. 3 and Fig. 5) and the related supplementary analyses. Using MDA-MB-231 triple-negative breast cancer cells, we generated CRISPR/Cas9 knockouts of CAPN1, CAPN2, and CAPNS1 (the two catalytic and the common regulatory subunit required for calpain-1/2 heterodimers). The data contain images of lungs and of microscopic randomly selected regions of interest thereof harvested from the calpain-deficient tumor bearing Rag2-/-IL2Rgc-/- mice, fluorescently imaged in a GFP channel (Ex/Em: 488/510nm); each hyperintense nodule is a GFP-positive metastatic lesion. Abbreviations: CAPN1, C1 - calpain-1 catalytic subunit. CAPN2, C2 - calpain-2 catalytic subunit. CAPNS1, S1 - calpain small regulatory subunit 1. KO - CRISPR/Cas9 gene knockout. R - gene rescue, addback.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,126 | 0,066 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».