Notice bibliographique
Résumé
Raw Image data that were analysed to be presented in Figure 6. If image data is not of interest, see https://doi.org/10.5683/SP2/0SHJNT where we uploaded the final data plotted in Figure 6. Here see "Figure6_SummarizeColocImageData.xlsx" for summary of Image data including cell line used, BH3 mimetics tested and size of datasets. This helps navigate the subfolders to find the images of interest. Data was organised by date of the experiment. Within each folder see, '.Tiffs' exported from PerkinElmer Harmony software. Files names for example "r02c02f01p01-ch1..." indicating the image is from row 2, column 2, field of view 1, position 1 and channel 1. Within each folder see "Analysis" Sub folder where one can find: -"SaveImagingConfiguration.xlsx" where we saved the imaging settings from the Phenix microscope. The objective lens, excitation/emission settings for channels 1,2,3,4 (in order that they appear), and number of fields of view acquired for that experiment can be found here. -.xlsx file with "platemap" included in filename. Shows detailed map of Cells/Treatment within 384 well plate. Use Row/Column information to navigate the image data. -Subfolder labelled "CP_results" : include results the object-level (single cell) results exported from Cell Profiler. These data were plotted separately in GraphPad Prism (see .pzf file) to determine the states o from each replicate. Then, median values were plotted in Figure 6 from 3+ replicates. See "Figure6_CombinedFinalColocResults.xlsx" where we combine the final results ultimately plotted in Figure 6.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,016 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,006 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,550 | 0,457 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».