Tufted Puffin (Fratercula cirrhata) 3dRADseq and msat data
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The tufted puffin (Fratercula cirrhata) is a medium sized seabird found throughout the North Pacific Ocean. Although populations of tufted puffins appear to be stable or increasing in some parts of their distribution, they are experiencing significant declines in other parts of their distribution, including in the Gulf of Alaska. Assessments of tufted puffin population status in Alaska are currently limited because little is known about population genetic structure. Similarly, there is little information on the amount of dispersal between populations in Alaska, and between populations in Alaska and those in the southern portion of the species’ range. If genetic analyses reveal significant genetic differentiation between tufted puffins nesting in different regions of Alaska, or evidence of local adaptation, then the apparent decline in the Gulf of Alaska becomes more of a conservation concern. There is general consensus within the tufted puffin research and management community that a study of population genetic structure is a high priority. As part of our ongoing research, we conducted genetic analysis to determine if tufted puffin nesting colonies form single or multiple conservation units, and populations show evidence of local adaptation, using traditional population genetic analysis and next-generation sequencing techniques. Continuing analyses of genome-wide associations between environment and genetic adaptation for tufted puffins will also provide greater insight into how coastal seabird populations in the temperate North Pacific Ocean are coping with the effects of climate change.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,114 | 0,062 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».