Replication Data for: Ice age refugium shows potential of geohistorical data to guide modern conservation efforts
Notice bibliographique
Résumé
This repository contains the code and data required to replicate Figures 3, 4, S1–S3, and Movies S1-S3 for the manuscript entitled "Geohistorical data reveal an ice age refugium with implications for modern conservation." Also contains the code required to perform the associated Monte Carlo simulations. Manuscript summary: Identifying refugia can provide important insights for conservationists planning protected areas. However, most current methods for identifying refugia emphasize short-term survivorship during a crisis rather than long-term recovery. Here, we propose a method for identifying refugia that emphasizes range re-expansion, and we present a case study using pollen data from three plant taxa over the past 20 kyr in northern Alaska, USA to evaluate the method’s validity. We identified a substantial decrease and subsequent recovery in spruce presence across the study region between 16.0–11.0 ka and tested the pattern’s significance using a Monte Carlo analysis. During this interval of relatively warm and dry regional climate, spruce persisted in one locality that acted as a source for post-crisis re-expansion, indicating that this locality was a refugium. Using this method to understand how successful refugia form in different crises would provide conservationists with more informative guidelines for planning protected areas.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,009 | 0,089 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,004 | 0,001 |
| Communication savante | 0,004 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,004 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,602 | 0,336 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».