MOESM1 of Genetic architecture of quantitative traits in beef cattle revealed by genome wide association studies of imputed whole genome sequence variants: I: feed efficiency and component traits
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1: Figure S1. Distribution of SNP allele substitution effects (left) and additive genetic variances explained by single SNPs (right) for RFI, DMI, ADG, and MWT based on 7.8 M whole genome sequence (WGS) variants; Figure S2. The enriched cellular and molecular functions (top) and cell morphology network (bottom) for RFI; Figure S3. The enriched cellular and molecular functions (top) and carbohydrate metabolism network (bottom) for DMI; Figure S4. The enriched cellular and molecular functions (top) and carbohydrate metabolism network (bottom) for ADG; Figure S5. The enriched cellular and molecular functions (top) and cellular compromise network (bottom) for MWT; Figure S6. Lipid metabolism network for RFI and its component traits DMI, ADG, and MWT; Figure S7. Common lead significant SNPs with the same IDs (a) and candidate genes (b) among RFI and its three component traits at thresholds P-value < 1.00E-05 and FDR < 0.10 based on the imputed 7.8 M DNA variant GWAS; Figure S8. Principal component analyses of Canadian beef cattle populations (N = 7573) based on the 50 K (a) and 7.8 M WGS (b) panels.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,010 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,285 | 0,012 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».