Mechanistic inhibition of human papillomavirus-associated cervical cancer and DNA polymerase theta receptor by natural Apigenin derivatives: An extensive drug design and computational approach
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The present study deals with the advanced in-silico analyses of several Apigenin derivatives to explore human papillomavirus-associated cervical cancer and DNA polymerase theta inhibitor properties by molecular docking, molecular dynamics, QSAR, drug-likeness, PCA, a dynamic cross-correlation matrix and quantum calculation properties. Initially, the literature study revealed that Apigenin has potent antimicrobial and anticancer properties. So, their potential derivatives are picked up to determine human papillomavirus-associated cervical cancer and DNA polymerase theta inhibitor properties . The findings were streamlined by exposing the in silico molecular docking, highlighting that all the Apigenin derivatives exhibit prospective interactions of energy binding with targeted proteins. The Apigenin 4'-O-Rhamnoside and Apigenin-4'-Alpha-L-Rhamnoside were more potent against HPV45 oncoprotein E7 (PDB ID 2EWL), where the Apigenin and Apigenin 5-O-Beta-D-Glucopyranoside showed significant binding energy against L1 protein of human. Similarly, the binding affinity range is achieved from -7.5 kcal/mol to -8.8 kcal/mol against DNA polymerase theta, representing that Apigenin derivatives should inhibit the DNA polymerase theta (PDB ID 8E23). Then, this finding was confirmed by molecular dynamic simulation at 100ns and analysis of different parameters such as RMSD, RMSF, SASA, H-bond, and RoG profiles and it is found that our selected compounds were found to be potentially stable. When stability testing is passed, the ADMET, pharmacokinetics, and drug-likeness properties are screened and fulfilled by all the criteria. Moreover, QSAR, PCA, Dynamic cross-correlation matrix, and quantum calculation were also conducted and the outcome was satisfied. As this study was carried out using in silico computational approaches and obtained outstanding results. So, to validate these results, further wet-lab experiments might be carried out under in vivo and in vitro conditions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».