Additional file 1 of Real-time quantitative PCR assay development and application for assessment of agricultural surface water and various fecal matter for prevalence of Aliarcobacter faecis and Aliarcobacter lanthieri
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1: Supplementary Figure 1A&B. Real-time qPCR amplified product confirmation on 2% agarose gel for A. faecis LMG 28519 reference strain and field isolates (Panel A; Lanes 1–4) and A. lanthieri reference strain LMG 28516 and field isolates (Panel B; Lanes 1–4) with an expected 152 and 72 bp sizes, respectively. Lanes 5 and 11: A. butzleri, A. cryaerophilus, A. skirrowii, A. thereius, A. trophiarum, A. cibarius and no DNA template (PCR reaction mix) served as negative controls; M: 100 bp DNA size marker. Supplementary Figure 2A&B. Real-time qPCR amplified product confirmation on 2% agarose gel showing positive and negative field samples for A. faecis (Panel A) and A. lanthieri (Panel B) with an expected 152 and 72 bp sizes, respectively. Lane 1: A. faecis and A. lanthieri reference strains served as positive controls; M: 100 bp DNA size marker.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,018 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,844 | 0,177 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».