Additional file 1 of Cell-based passive immunization for protection against SARS-CoV-2 infection
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1. Figure S1: Isolation of clonal transgenic mESC pools. (A) Transfected FS-mESCs constitutively express luciferase from a piggyBac transposon vector for downstream in vivo tracking of cells. Enhanced firefly luciferase expression is linked to an eGFP fluorescent reporter within the expression cassette. TR, terminal repeat; IRES, internal ribosome entry site; pA, polyadenylation. (B) Flow cytometry plots for fluorescence-activated cell sorting of transfected FS-mESC pools. Gates indicate mESCs single-cell sorted for high mCherry and eGFP expression to establish clonal mESCs expressing each SARS-CoV-2 nBio format. The ‘wild-type’ (with respect to any neutralizing biologic transgene) and parental mESCs are mCherrydim from the FailSafeTM locus, in which mCherry is transcriptionally linked to the HSV-TK gene by a 2A peptide in a homozygous manner [42]. Figure S2: Bioluminescence image tracking of mESC transplant recipients. All transplanted mESCs constitutively expressed luciferase transgenes and were thus tracked over the experimental periods. Representative bioluminescence images of two animals per group are shown. (A) Parental FS-mESC and (B) clonal scFv-Fc 33-7 transgenic FS-mESC lines transplanted into B6 recipients (n = 8 and n = 9 animals, respectively). (C) Parental FS-iACT-mESC line and (D and E) clonal transgenic FS-iACT-mESC lines expressing scFv-Fc and Db-Fc-scFv 33-7, respectively, transplanted into NSG and B6 recipients (all n = 5 animals per group). Luc, luciferase. Figure S3: Development of clonal transgenic FS-iACT mESCs. (A) A B6-derived FS-iACT-mESC line (luciferase+, upper expression vector) was separately transfected with the piggyBac transposon expression vectors containing scFv-Fc 33-7 and Db-Fc-scFv 33-7 (lower vector, nBio expression linked to an mCherry fluorescent reporter). (B) Flow cytometry plots for fluorescence-activated cell sorting of the two transfected FS-mESC pools. Upper right gates indicate mESCs single-cell sorted for high mCherry and eGFP expression to establish clonal mESCs expressing the two nBio formats. (C) Images of transgenic clonal mESCs expressing the two different nBio transgenes linked to mCherry. All scale bars are 65 μm. Wt, wild-type. (D) Quantification of scFv-Fc and Db-Fc-scFv 33-7 secreted into the culture supernatant by clonal transgenic FS-iACT-mESCs by anti-human Fc ELISA. Each dot represents a separately generated clone expressing the same nBio format, according to its color. Bars represent the mean clonal secretion of nBio formats ± SEM. Statistical significance was determined by one-way ANOVA test with Tukey’s multiple comparisons test. **P = 0.005; ***P < 0.0001. ns, not significant; ND, not detected. Figure S4: In vivo transplantation of unmodified, parental mESCs. (A-B) Five million parental B6 luciferase+ mESCs were subcutaneously injected into the dorsal flank of mice (A, FS-mESCs into B6 animals, n = 8; B, FS-iACT-mESCs into NSG and B6 animals, n = 5 for each group). (C-D) Flank teratoma growth over the experimental period, measured by calipers. Ganciclovir (GCV) was administered to all mice over the indicated period to stabilize teratomas. Each line represents a single mouse per group. The dashed line indicates the minimum measurable teratoma volume with calipers, while teratomas are still present and palpable. As expected, no SARS-CoV-2 nBios were detected in the plasma of these mice by anti-human Fc ELISA.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,022 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,903 | 0,252 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».