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Enregistrement W6902076072 · doi:10.6084/m9.figshare.17982578

Additional file 3 of MicroRNA-210 regulates the metabolic and inflammatory status of primary human astrocytes

2022· article· en· W6902076072 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroinflammation and Neurodegeneration Mechanisms
Établissements canadiensMcGill University Health CentreQueen's UniversityMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlial fibrillary acidic proteinMicrogliaAstrocyteDownregulation and upregulationHuman brainPrimary cellIn vitroS100A9Myelin basic protein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Additional file 3: Figure S2. Primary human fetal astrocytes respond to in vitro stresses, and mice upregulate miR-210 around ischemic lesions. (A) Primary human astrocytes, oligodendrocytes, and microglia were separately cultured and analyzed for expression of canonically expressed genes of glial fibrillary acidic protein (GFAP), myelin basic protein (MBP) and ionized calcium binding adaptor molecule 1 (IBA1) by RT-qPCR. n = 3–4. (B) Primary human fetal astrocytes were immunostained with anti-GFAP, anti-O4, and anti-PU.1 antibodies. A CX7 automated microscope was used to quantify the percent positive astrocytes for each marker, n = 4. (C) Primary human astrocytes were treated in inflammatory (“I”) metabolic (“M”) or hypoxic (“H”) stress conditions induced by IL1b, glucose-free media, or a 1% oxygen chamber for 24 h compared to untreated control. RT-qPCR assessment of CXCL10, HMOX1, and MCT4 expression was measured to confirm the astrocytic response to inflammatory, metabolic, and hypoxic stress conditions, respectively, n = 4–6. (D) HeLa cells were left in normoxic (“N”) conditions for 48 h or were treated in 1% O2 (hypoxia, H) for the noted time. After 2–48 h, the cells were removed and were immediately lysed with RIPA buffer for subsequent Western blot. n = 3. (E) Graphical representation of the area investigated for miR-210 expression using miRscope. miR-210 was quantified in the highlighted region around the infarct site (left), and in the respectively highlighted region on the contralateral side of the brain (right). 300–500 cells were counted per brain section. (F) Representative images and quantification of microRNAscope (miRscope) of miR-210 around MCAO lesions (labeled as infarct) or on the contralateral side of the brain (labeled as control). Scale bar = 20 µm. Quantification was performed by manual counting of the number of nuclei positive for one or more red puncta. Red dots show miR-210 expression, and DAPI (blue) was used as a counterstain. Each dot in image F represents a separate tissue section all derived from one mouse, resulting in five sections imaged per brain region.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,030
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,884
Score d'incertitude au seuil0,166

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,030
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,8840,193

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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