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Enregistrement W6902160081 · doi:10.6084/m9.figshare.13544170

Additional file 5 of PD-1 blockade delays tumor growth by inhibiting an intrinsic SHP2/Ras/MAPK signalling in thyroid cancer cells

2021· article· en· W6902160081 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransfectionImmunofluorescenceImmunoprecipitationBlotAntibodyRecombinant DNAExpression vectorHEK 293 cells

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Additional file 5: Supplementary Figure 4. Effects of intrinsic PD-1 on SHP2 localization and functions. A. Expression levels of PD-1, phospho-PD-1, SHP2 and phospho-SHP2 in 8505c and TPC-1 cells transiently transfected with pFLAG PD-1 or the empty vector pFLAG, assessed by western blot. A representative experiment is shown. B. Immunofluorescence microscopy of 8505c cells, transiently transfected with pFLAG PD-1 or the empty vector, with antibody specific for SHP2. Arrows indicate the surface signal of SHP2. Bars, 5 μm. A representative experiment is shown. C. Immunofluorescence microscopy of 8505c cells transiently transfected with pCMV6 PD-1-GFP and stained with antibody specific for SHP2, and the merged signal. Arrows indicate the surface signal of SHP2. Bars, 5 μm. A representative experiment is shown. D. Total protein extracts from TPC-1 cells transiently transfected with pFLAG-PD-1 or the empty vector pFLAG were subjected to a pull-down assay using the indicated recombinant proteins or to immunoprecipitation using the indicated antibodies. Proteins were immunoblotted with antibody against SHP2 or GRB2. A representative experiment is shown. E. Total cell protein extracts from 8505c cells transiently transfected with combination of pCEFL H-Ras AU5, pFLAG PD-1 or empty vector (pFLAG + pCEFL) were subjected to immunoprecipitation with anti-phospho tyrosine followed by western blotting with pan (RAS) antibody. A representative experiment is shown, together with the mean densitometric analysis ± SD of 5 independent assays. * P<0.05 compared to the relative control.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,016
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,886
Score d'incertitude au seuil0,163

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,016
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,8860,175

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
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