Additional file 2 of Gut-derived metabolites influence neurodevelopmental gene expression and Wnt signaling events in a germ-free zebrafish model
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 2: Supplemental Figure 1. WMISH of notch1b in 2dpf embryos that were derived germ-free and then reintroduced to CV embryo medium. Supplemental Figure 2. Relative Abundance of bacteria in zebrafish gut sample versus zebrafish water sample at the phylum level. Taxonomy was assigned using a training set of reference sequences via the Silva 138.1 prokaryotic SSU taxonomic training data formatted for DADA2. Supplemental Figure 3. Relative Abundance of bacteria in zebrafish gut sample versus zebrafish water sample at the genus level. Taxonomy was assigned using a training set of reference sequences via the Silva 138.1 prokaryotic SSU taxonomic training data formatted for DADA2. Supplemental Figure 4. WMISH of axin2 in 2dpf embryos that were derived germ-free and then treated once, or twice with zebrafish metabolites. Supplemental Figure 5. Single layer composite of axonal tracks. Supplemental Figure 6. Projected images of a-tubulin and GFAP:GFP expression. 3dpf lateral line composite trunk. Supplemental Figure 7. WMISH of 4 and 5 dpf larvae with notch, ascl1a and isl1 Supplemental Figure 8. 3dpf lateral line composite. Supplemental Figure 9. 3dpf lateral line composite of posterior lateral line. Supplemental Figure 10. 4 dpf lateral line composite of posterior lateral line. Supplemental Figure 11. KEGG images of various signalling pathways.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,728 | 0,115 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».