Additional file 1 of Ground truth labels challenge the validity of sepsis consensus definitions in critical illness
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1: Appendix S1. Questionnaire for the evaluation of SIRS and sepsis. Appendix S2. Agreement and performance of clinical criteria for Sepsis-1/2 and Sepsis-3 compared to GTSQ sepsis labels. Text S1. GTSQ construction and survey implementation. Text S2. Encounter definition. Text S3. Methods for evaluation of interrater agreement. Text S4. Features for SIRS and SOFA. Text S5. Supplementary results of interrater reliability study. Table S1. Contingency table for working diagnoses (Item 3) of interrater reliability study. Table S2. Krippendorff’s α values for questionnaire items of interrater reliability study. Table S3. Additional measures of agreement of questionnaire items in interrater reliability study. Table S4. GTSQs with labels for acute organ dysfunction (Item 9) by working diagnosis (Item 3). Table S5. Association of acute organ dysfunction (Item 9) with focus localization (Item 5). Table S6. Characteristics of complete encounters by working diagnosis (Item 3) in the subgroup analysis. Table S7. Responses to GTSQ items by working diagnosis label (Item 3) in the subgroup analysis. Fig. S1. Clinical characteristics for all edited GTSQs by working diagnosis (Item 3). Values of clinical characteristics in the 2 PM–2 PM-rating intervals for all 7.291 edited GTSQs (cf. Table 3 of the main text) were retrieved from the ICU’s PDMS. Mean values are displayed as box plots colored by working diagnosis (Item 3) as indicated in the legend.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,009 | 0,187 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,003 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,847 | 0,161 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».