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Enregistrement W6903391180 · doi:10.1139/cjps2012-111

Fungal endophyte colonization coincides with altered DNA methylation in drought-stressed wheat seedlings

2014· article· en· W6903391180 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueBioOne Complete (BioOne) · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and fungal interactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndophyteEpigeneticsDNA methylationColonizationTransposable elementRetrotransposonDNAMethylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hubbard, M., Germida, J. J. and Vujanovic, V. 2014. Fungal endophyte colonization coincides with altered DNA methylation in drought-stressed wheat seedlings. Can. J. Plant Sci. 94: 223-234. Drought stress is one of the greatest limiting factors to Canadian agricultural production. The endophytic fungus SMCD 2206 improves wheat tolerance for drought. However, the mechanism(s) by which this mycobiont interacts with its host are not known. Methyl-sensitive amplified polymorphism (MSAP) was used to test the hypothesis that the endophyte colonization is associated with epigenetic modifications in drought-stressed wheat. Such epigenetic changes might be linked to elevated plant drought resistance. The DNA methylation patterns observed in drought-stressed wheat seedlings co-cultured with SMCD 2206 resembled those of unstressed controls (with or without the endophyte) much more closely than those of endophyte-free, drought-stressed plants. Consistent with the documented roles of transposable elements in plant epigenetics, DNA sequences isolated from some of the most prominent polymorphic MSAP bands were similar to a CACTA type transposon and two retrotransposons of Gypsy and Copia types. Another polymorphic band was similar to a wheat cytochrome p450 expressed sequence tag, suggesting that inoculation may be linked to altered plant responses to oxidative stress in drought conditions. These findings shed new light on the mechanisms involved in plant-endophyte associations, showing that SMCD 2206 colonization of wheat coincides with epigenetic differences in the plant host.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,862
Score d'incertitude au seuil0,449

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,196
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,030 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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