Fungal endophyte colonization coincides with altered DNA methylation in drought-stressed wheat seedlings
Notice bibliographique
Résumé
Hubbard, M., Germida, J. J. and Vujanovic, V. 2014. Fungal endophyte colonization coincides with altered DNA methylation in drought-stressed wheat seedlings. Can. J. Plant Sci. 94: 223-234. Drought stress is one of the greatest limiting factors to Canadian agricultural production. The endophytic fungus SMCD 2206 improves wheat tolerance for drought. However, the mechanism(s) by which this mycobiont interacts with its host are not known. Methyl-sensitive amplified polymorphism (MSAP) was used to test the hypothesis that the endophyte colonization is associated with epigenetic modifications in drought-stressed wheat. Such epigenetic changes might be linked to elevated plant drought resistance. The DNA methylation patterns observed in drought-stressed wheat seedlings co-cultured with SMCD 2206 resembled those of unstressed controls (with or without the endophyte) much more closely than those of endophyte-free, drought-stressed plants. Consistent with the documented roles of transposable elements in plant epigenetics, DNA sequences isolated from some of the most prominent polymorphic MSAP bands were similar to a CACTA type transposon and two retrotransposons of Gypsy and Copia types. Another polymorphic band was similar to a wheat cytochrome p450 expressed sequence tag, suggesting that inoculation may be linked to altered plant responses to oxidative stress in drought conditions. These findings shed new light on the mechanisms involved in plant-endophyte associations, showing that SMCD 2206 colonization of wheat coincides with epigenetic differences in the plant host.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».