Impacts of sedimentation on early-life phenotypes and gene expression in coho salmon (Oncorhynchus kisutch)
Notice bibliographique
Résumé
Early-life environmental stressors may threaten species of conservation concern by impacting populations during vulnerable early life history stages. Here, I tested some of the effects of sediment stress and hypoxia during early-life development on phenotypic outcomes and gene expression in coho salmon (Oncorhynchus kisutch). I obtained O. kisutch eggs from the Sugsaw Hatchery located on Vancouver Island, BC, and reared them in one of three substrate (0% fine sediment, 10% fine sediment, 20% fine sediment) or one of two no substrate (normoxia/100% DO or hypoxia/50% DO) treatments to the alevin stage (n=180 per treatment). Survival did not differ between groups, but fish reared in hypoxia and 20% fine sediment exhibited significantly lower fork lengths and weights. Yolk sac area and volume were also lower in fish from the 20% fine sediment treatment, suggesting a decrease in yolk sac conversion efficiency. Gene expression analysis of three general (HIF1A_6, ALD_1, HemA1_1) and four hypoxia-specific (Anillin, Ncapd3, Ndc80, Kif4) biomarkers revealed significant upregulation of ALD_1 expression in hypoxia-reared fish, while fewer significant differences were detected in the remaining biomarkers. Overall, more research is necessary to elucidate the genomic mechanisms mediating the phenotypic changes that result from exposure to hypoxia and high sedimentation in early-life salmonids. Yet these findings suggest that there may be negative consequences of sedimentation and hypoxia during early-life salmonid development and that these are driven by complex molecular interactions that underlie early-life organisms’ responses to stress. Reduced growth and yolk sac conversion efficiency in fish reared without substrate, compared to high quality substrate further suggest that substrate environmental enrichment (EE) during early-life rearing may be beneficial for salmonids artificially reared in hatcheries.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».