MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W6906628046 · doi:10.17632/bk45c9yxb9

CRICVA Database

2019· dataset· en· W6906628046 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueMendeley Data · 2019
Typedataset
Langueen
Domaine
Thématique
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPixelEye trackingImage processingFixation (population genetics)Tracking (education)Notice

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The CRICVA dataset contains eye tracking data for a subset of 232 digitized Pap smear images of the CRIC Center (https://sites.google.com/view/centercric). The CRIC images were acquired with a Carl Zeiss microscope equipped with a Zeiss AxionCam MRc camera at 40x magnification. The images have 0.255 μm/pixel and resolution of 1392 x 1040 pixels (8-bit). The specimens were prepared via conventional Pap smears and contain cervical cells as well as other artifacts often collected as part of the exams. All cervical cell images were collected from SUS (Brazilian Universal Health System). ---- Detailed Information 1. Pap smear images The CRIC images were presented to cytopathologists at a resolution of 1280x1024 pixels, keeping the original aspect ratio by adding white pixel lines at the image bottom. Notice that the added white pixel lines have been removed from the attached images. 2. Eye tracking device We used an EyeLink 1000 system designed by SR Research Ltd., Mississauga, Canada, with a sampling rate of 1000 Hz on the right eye recording to register the visual attention of cytopathologists. 3. Subjects CRICVA has eye fixation maps from three cytopathologists, all of them with normal or corrected-to-normal vision via lens glasses. The cytopathologists have experience with cervical care and reading conventional Pap smear slides on clinical laboratory. 4. Methodology The attention data was collected by a task-driven experiment in which the expert interpreted each cervical cell image and marked the abnormal cells with mouse clicks. The participants had free time to analyze the images. ---- Database Organization CRICVA comprises samples for normal (Negative) and abnormal (ASC-US: Atypical Squamous Cells of Undermined Significance; ASC-H: Atypical Squamous Cells of High Significance; LSIL: Low-grade Squamous Intraepithelial Lesion; HSIL: High-grade Squamous Intraepithelial Lesion; and CA: Carcinoma) cases. Our dataset contains eight folders each being relative to a trial. In each folder, there are the cervical cell images (sub-folder: images), the eye fixations (sub-folder: fixation_locs), and the attention maps (sub-folder: fixation_maps). For each trial, we also provide a text file (labels_trial_xx.txt) with the following information: image_id, image_name, image_class For example, 1,011fda505d7e4af4b8cc57545343624d,ASC-US 2,02c7fb946ad5c5e5f9c1e1178c21fc92,ca More information can be found in the references (related links) below. ---- Special Thanks: Dr. José Soares de Andrade Júnior and Dr. Humberto de Andrade Carmona for authorizing the use of the eye tracking device at the Complex Systems Laboratory, Department of Physics, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, CE, Brazil. ---- Feedback on the dataset is welcome. The person to contact is Daniel Ferreira (daniels@ifce.edu.br)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Science ouverte, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesScience ouverte, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,357
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0120,012
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,368

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,220
Tête enseignante GPT0,388
Écart entre enseignants0,168 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMendeley DataTravaux en français237 207