Molecular and Epigenetic Consequences of Short-Term Hypoxia Exposure in Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss)
Notice bibliographique
Résumé
Environmental hypoxia affects freshwater systems, and acute hypoxic events are expected to increase in frequency with climate change. Rainbow trout (Oncorhynchus mykiss), a salmonid species of economic and cultural importance in Canada and introduced to freshwaters across most continents, is an active species that is sensitive to environmental hypoxia. In this thesis, I investigate the hypothesis that rainbow trout acutely exposed to mild (50% oxygen saturation) and severe (25% oxygen saturation) hypoxia exhibit rapid metabolic changes which are indicative of anerobic glycolytic and are, at least in part, mediated at the gene expression level and I hypothesize that these changes in gene expression are mediated by histone modifications. While glucose and lipid metabolite concentrations are not significantly affected by acute hypoxia exposure suggesting tight regulation to maintain steady-state, transcripts coding for key components of glucose, lactate, and lipid transcripts are differentially induced in a tissue-specific manner. Hepatic transcripts were most sensitive to hypoxia, favouring induction of transcripts related to glucose metabolism like in white muscle tissue. Under severe hypoxia exposure, coordinated expression of transcripts related to lipid metabolism was observed in liver, but also muscle and adipose tissue, possibly indicating a scavenging response of peroxided lipids rather than a use as fuel. When probing a role for the O2-sensitive epigenetic mark H3K4me3 in upstream prompter regions of induced hepatic genes mct1 and pck1, no clear relationship between O2-dependent regulation of this mark and gene expression was found, suggesting other transcriptional control mechanisms are involved. Together, this thesis provides novel insight into molecular underpinnings and thresholds of tissue-specific metabolic responses in rainbow trout and opens the field for future comparative investigation of epigenetic mechanisms of responses to hypoxia in fishes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».