MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W6908338679 · doi:10.26091/esrnz.11375769

NIST interlaboratory studies involving DNA mixtures (MIX13): A modern analysis

2019· article· en· W6908338679 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueESR Data and information Repository · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueForensic and Genetic Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNISTConsistency (knowledge bases)Interpretation (philosophy)Probabilistic logicMeasure (data warehouse)GenotypingStatement (logic)Multiplex

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MIX13 was an interlaboratory exercise directed by NIST in 2013. The goal of the exercise was to evaluate the general state of interpretation methods in use at the time across the forensic community within the US and Canada and to measure the consistency in mixture interpretation. The findings were that there was a large variation in analysts’ interpretations between and within laboratories. <br>Within this work, we sought to evaluate the same mock mixture cases analyzed in MIX13 but with a more current view of the state-of-the-science. Each of the five cases were analyzed using the Identifiler™ multiplex and interpreted with the combined probability of inclusion, CPI, and four different modern probabilistic genotyping systems. Cases 1–4 can be interpreted without difficulty by any of the four PG systems examined. Cases 1 and 4 could also be interpreted successfully with the CPI by assuming two donors. <br>Cases 2 and 3 cannot be interpreted successfully with the CPI because of potential of allele dropout. Case 3 demonstrated the need to consider relevant background information before interpretation of the profile. This case does not show that there is some barrier to interpretation caused by relatedness beyond the increased allelic overlap that can occur. Had this profile been of better template it might have been interpreted using the CPI despite the (potential) relatedness of contributors. <br>Case 5 suffers from over-engineering. It is unclear whether reference 5C, a non-donor, can be excluded by manual methods. Inclusion of reference 5C should be termed an adventitious match not a false inclusion. Beyond this statement this case does not contribute to the interlaboratory study of analyst/laboratory interpretation method performance, instead, it explores the limits of DNA analysis. <br>Taken collectively the analysis of these five cases demonstrates the benefits of changing from CPI to a PG system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,424
Score d'incertitude au seuil0,349

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueESR Data and information RepositoryMême sujetForensic and Genetic ResearchTravaux en français237 207