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Enregistrement W6909012700 · doi:10.3389/fpls.2024.1401265.s002

Table_1_Lignin accumulation in cell wall plays a role in clubroot resistance.xlsx

2024· dataset· en· W6909012700 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2024
Typedataset
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWater management and technologies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésClubrootPathogenPhenylpropanoidLigninCell wallGeneBrassicaceaePlant disease resistanceCanola

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clubroot, caused by Plasmodiophora brassicae, is a significant disease affecting brassica crops worldwide and poses a threat to canola (Brassica napus) production in western Canada. Management of this disease heavily relies on the use of resistant cultivars, but resistance erosion is a serious concern due to the highly diverse pathogen populations. Understanding resistance mechanisms may aid in better deployment/rotation of clubroot resistance (CR) genes and improve resistance resilience. In this study, we conducted a comparative analysis using resistant canola varieties carrying either a single (Rcr1) or double CR genes (Rcr1+Crr1<sup>rutb</sup>) to decipher the resistance modes associated with these genes. Cell wall (CW) biopolymeric compounds in different root layers were mapped and quantified using Fourier-transform mid-infrared microspectroscopy for changes in CW elements associated with clubroot resistance. Transmission electron and confocal microscopy were used to assess root infection details and relative transcript abundance was analyzed to determine the activation of the lignin-related pathway in relation to resistance. Neither resistant variety affected the primary infection of root hairs/epidermal cells compared to the susceptible “Westar”, but both exhibited strong inhibition of cortical infection, effectively ‘trapping’ the pathogen in the exodermis. The most prominent change observed was increased lignin accumulation associated with resistance. In Westar, the pathogen was able to degrade CW lignin, facilitating access to the root cortex by secondary plasmodia of P. brassicae. In contrast, resistant varieties showed clear lignin accumulation around the penetration site on the exodermis, accompanied by elevated expression of genes involved in the phenylpropanoid pathway. These results suggest that induced lignin accumulation plays a role in clubroot resistance mediated by the CR genes Rcr1 and Crr1<sup>rutb</sup> in canola, providing cellular and structural evidence that supports the data from earlier transcriptomic studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,994

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0330,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle