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Enregistrement W6911028423 · doi:10.5061/dryad.np5hqbzrc

Fitness maps to a large-effect locus in introduced stickleback populations

2020· dataset· en· W6911028423 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueDRYAD · 2020
Typedataset
Langueen
Domaine
Thématique
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSticklebackLocus (genetics)AlleleAllele frequencyPopulationOffspringSelection (genetic algorithm)GasterosteusAdaptation (eye)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations of small effect underlie most adaptation to new environments, but beneficial variants with large fitness effects are expected to contribute under certain conditions. Genes and genomic regions having large effects on phenotypic differences between populations are known from numerous taxa, but fitness effect sizes have rarely been estimated. We mapped fitness over a generation in an F2 intercross between a marine and a lake stickleback population introduced to a freshwater pond. A QTL map of the number of surviving offspring per F2 female detected a single, large-effect locus near Ectodysplasin (Eda), a gene having an ancient freshwater allele causing reduced bony armor and other changes. F2 females homozygous for the freshwater allele had twice the number of surviving offspring as homozygotes for the marine allele, producing a large selection coefficient, s = 0.50 ± 0.09 SE. Correspondingly, the frequency of the freshwater allele increased from 0.50 in F2 mothers to 0.58 in surviving offspring. We compare these results to observed allele frequency changes at the Eda gene in an Alaskan lake population colonized by marine stickleback in the 1980’s. The frequency of the freshwater Eda allele rose steadily over multiple generations and reached 95% within 20 years, yielding a similar estimate of selection, s = 0.49 ± 0.05. These findings are consistent with other studies suggesting strong selection on this gene (and/or linked genes) in fresh water. Selection on ancient genetic variants carried by colonizing ancestors is likely to increase the prevalence of large-effect fitness variants in adaptive evolution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,125
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,126

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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