Data from: Chromosomal inversions in the Atlantic cod genome: implications for management of Canada’s Northern cod stock
Notice bibliographique
Résumé
Following stock collapse and over twenty years of moratoria, the state of Canada’s Northern Atlantic cod (Gadus morhua) remains precarious. To test if recent stock growth was of endogenous or exogenous origin, we performed a whole genome scan (ddRAD) on 135 adults captured in 2015 at three offshore spawning locations spanning the range of the offshore stock along the northeastern Newfoundland and Labrador shelf (Hawke Channel, Notre Dame Channel and Bonavista Corridor), with an additional 105 adults from three more southern locations (St. Anns Bank, Browns Bank and Bay of Fundy). Population structure analysis using 5,077 single nucleotide polymorphisms (SNPs) detected a distinct genetic break off the coast of Nova Scotia near 45 °N. Gene flow between groups north and south of this divide appears to be limited despite the presence of several northern-type and admixed individuals present in the southern area. North of the genetic divide, allele frequencies of neutral loci were indicative of a panmictic population. Several outlier SNPs were found to be associated with ecologically relevant physical characteristics (visual pigments, fin development, response to hypoxia, and various metabolic processes), which may be indicative of different ecological niches.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,014 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,028 | 0,008 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».