Data from: Transcriptome comparative analysis of two Camellia species reveals lipid metabolism during mature seed natural drying
Notice bibliographique
Résumé
AbstractCamellia seed oil has been used as high quality and healthy food for over two thousand years. Seed drying management effects oil quality and quantity. however, the molecular mechanisms of fatty acid biosynthesis and accumulation during the drying process remain unknown. In this study, the transcriptomes of Camellia meiocarpa and C. oleifera seed were characterized at five moisture content levels (10 - 50%) to identify the major processes and reveal genes affecting lipid metabolism in response to nature drying. We found a total of 111,156 unigenes by de novo assembled from RNA-Seq libraries of five moisture content levels during after-ripening of C. meiocarpa (74,016) and C. oleifera (76,374). Ten pathways were closely linked to changes in oil content and composition with 244 genes involved in fatty acid synthesis and accumulation. Gene Ontology enrichment of differentially expressed genes (DEGs) indicated that fatty acid synthesis and accumulation are essential in C. meiocarpa while fatty acid accumulation in C. oleifera during nature drying process. Comparative analyses of DEGs between any two consecutive moisture contents, identified six and three key unigenes in C. Meiocarpa and C. oleifera seeds, respectively, and one additional unigene responsible for the difference between the two species’ fatty acid synthesis and accumulation. Natural drying has improved the quality and quantity of the camellia seed oil. The study provided: a) global transcriptional profiles at five moisture content levels during seed nature drying, b) insights into highlighting transcripts putatively involved in the regulation of the gene expression program and in specific processes likely essential for lipid metabolism, and c) an opportunity to discovering genes associated with oil seed quantity and quality improvement for the studied two camellia species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».