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Enregistrement W6917380031 · doi:10.57745/dxvru4

Improved 2D 1H-13C NMR permits in vivo analysis of Daphnia magna metabolism without isotopic enrichment

2025· dataset· en· W6917380031 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueRecherche Data Gouv France · 2025
Typedataset
Langueen
Domaine
Thématique
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDaphnia magnaIn vivoHeteronuclear single quantum coherence spectroscopySampling (signal processing)DaphniaIsotope

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This dataset contains data from a study that assessed the feasibility of using nuclear magnetic resonance (NMR) to measure the real-time in vivo metabolic responses of the small freshwater crustacean, *Daphnia magna*, in samples derived from the wild (rather than raised in a laboratory) to investigate aquatic contaminant toxicity. To date, nearly all previous studies have used 13C isotopically enriched D.magna, but this limits studies to lab-raised organisms. These data were taken from an experimental approach that did not require isotopic enrichment, allowing samples to be taken directly from the environment. Due to overlap caused by the magnetic susceptibility distortions in 1D 1H NMR, 2D is required for metabolic fingerprinting in vivo. In particular, 2D 1H-13C NMR offers excellent spectral dispersion but is time-consuming and has intrinsic low sensitivity. To study D. magna in natural abundance, symmetric ASAP HSQC in combination with time-resolved non-uniform sampling (TR-NUS) was used. This combined approach (TR-NUS ASAP HSQC) improved sensitivity up to 3 times versus standard HSQC, while reconstruction of TR-NUS data provided information on a 4 minute time scale. In turn, this allowed anoxia (and recovery from anoxia) to be studied for the first time on unlabelled Daphnia using HSQC. This method could, therefore, become key for investigating environmental adaptability and exposure in living organisms in conditions that are closer to real-time.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Science ouverte, Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,001
Bibliométrie0,0030,012
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0090,003
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,100
Tête enseignante GPT0,386
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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