A human case of Streptococcus suis infection caused by an unencapsulated strain
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: Streptococcus suis, an emerging zoonotic pathogen, causes invasive infections in persons who are in close contact with infected pigs or contaminated pork‐derived products. Although serotype 2 is the most prevalent type in S. suis infections in humans, to the best of our knowledge no human case caused by an unencapsulated strain has been reported previously. Case presentation: A 53‐year‐old male alcohol misuser with liver cirrhosis was admitted with sepsis to a hospital in Sukhothai Province, Thailand. He had consumed a homemade raw pork product 3 days prior to the onset of illness. An isolate from blood culture was confirmed as S. suis by species‐specific PCR and 16S rRNA gene sequencing, and as untypeable by a coagglutination test. The absence of a capsule around the bacterial cells was also confirmed by transmission electron microscopy. The isolate was also confirmed as sequence type 28 by sequence typing, and analysis of the capsule locus detected disruption of the cpsE–cpsK region, which comprises an approximately 2.5 kb fragment that contains phosphatase and kinase genes. Conclusion: We have identified the first human S. suis infection caused by an unencapsulated strain in a patient with liver cirrhosis. This unencapsulated strain was attributable to a mutation of the cps gene. Clinicians should be aware of the emergence of S. suis infection caused by unencapsulated strains, especially in patients with liver cirrhosis.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».