Morphological and molecular identification reveals that waters from an isolated oasis in Tamanrasset (extreme South of Algerian Sahara) are colonized by opportunistic and pollution-tolerant diatom species
Notice bibliographique
Résumé
A water sample was obtained from an arheic oasis in the deep Sahara Desert, the Gueltates Afilal in Tamanrasset (Algeria). Five diatom strains were isolated, cultivated and identified as Tryblionella apiculata, Nitzschia supralitorea, Fistulifera saprophila, Navicula veneta and Thalassiosira pseudonana using a combination of scanning electron microscopy and next generation sequencing. The diatoms identified are opportunistic and cosmopolitan species with known tolerances to organic pollution and variations in salinities, often found in meso- and polysaprobic zones in Europe. Their complete organellar genomes have been sequenced and some exhibit features never observed among diatoms before. To our knowledge this is the first time that living specimens of diatoms from the deep Sahara are identified using modern taxonomical tools in the frame of a study which also demonstrates the possibility to cultivate such material in laboratories for further experiments on biogeography and bioindication. Our study also suggests that European identification keys can be effective when employed on diatoms from the Sahara.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».