Additional file 1 of Strain engineering and bioprocessing strategies for biobased production of porphobilinogen in Escherichia coli
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1: Table S1. DNA oligonucleotide sequences used in this study. Table S2. gRNA sequences targeting hemC for CRISPRi in this study. See Additiona file 1: Figure S1 for qRT-PCR results for select gRNAs. Table S3. Tabulated images of bioreactor cultivation samples under aerobic and microaerobic conditions. Table S4. Statistical analysis for comparing experimental data of PBG titers. Figure S1. Quantification of the relative hemC expression for select gRNAs using qRT‐PCR. All qRT‐PCR values are reported as means ± SD (n = 2). Figure S2. Bioreactor cultivation of DSL-D1∆iclR∆sdhA, DSL-D2∆iclR∆sdhA, DSL-D3∆iclR∆sdhA, and DSL-D4∆iclR∆sdhA for PBG biosynthesis under aerobic conditions. Time profiles of cell density (OD600), glycerol consumption and metabolite extracellular accumulation profiles are shown. (I) DSL-D1∆iclR∆sdhA, (II) DSL-D2∆iclR∆sdhA, (III) DSL-D3∆iclR∆sdhA, (IV) DSL-D4∆iclR∆sdhA. All values are reported as means ± SD (n = 2). Figure S3. Bioreactor cultivation of DSL-D5∆iclR∆sdhA, DSL-D6∆iclR∆sdhA, DSL-D7∆iclR∆sdhA, and DSL-D8∆iclR∆sdhA for PBG biosynthesis under aerobic conditions. Time profiles of cell density (OD600), glycerol consumption and metabolite extracellular accumulation profiles are shown. (I) DSL-D5∆iclR∆sdhA, (II) DSL-D6∆iclR∆sdhA, (III) DSL-D7∆iclR∆sdhA, (IV) DSL-D8∆iclR∆sdhA. All values are reported as means ± SD (n = 2).
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,014 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».