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Enregistrement W6920842266 · doi:10.6084/m9.figshare.15047827

Additional file 1 of Proteomic analysis revealed the roles of YRR1 deletion in enhancing the vanillin resistance of Saccharomyces cerevisiae

2021· article· en· W6920842266 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueOpen MIND · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical and biochemical processes
Établissements canadiensLakehead University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVanillinYeastSaccharomyces cerevisiaePlasmidKEGGStrain (injury)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Additional file 1: Table S1. Yeast strains used in this study. Table S2. List of primers used for plasmids and strain construction in this work. Figure S1. Influence of vanillin stress on KEGG pathway enrichment of down-regulated DEPs in CEN.PK2-1C background strains. Greater RichFactor indicates a greater effect of vanillin on the analyzed pathway. Figure S2. Influence of vanillin stress on KEGG pathway enrichment of upregulated DEPs in CEN.PK2-1C background strains. Greater RichFactor indicates a greater effect of vanillin on the analyzed pathway. Figure S3. Growth curve of overexpression of RTC3, HSP12 in presence of 6 mmol L−1 vanillin. BY4741(pJFE3) and BY4741(yrr1Δ, pJFE3) are the controls. Data are presented as the means ± standard errors of independent triplicate experiments. Figure S4. Growth curve of strains overexpressing translation related proteins encoding genes CAF20, LSM5, CGR1, GIS2, TIF11 cultured in SC-URA with 6 mmol L−1 vanillin. BY4741(pJFE3) and BY4741(yrr1Δ, pJFE3) are the controls. Data are presented as the means ± standard errors of independent triplicate experiments. Figure S5. Spot growth of BY4741(yrr1Δ) with different inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,048
Score d'incertitude au seuil0,953

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0480,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
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Résumé présentoui

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