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Enregistrement W6920882686 · doi:10.6084/m9.figshare.14617113

Metadata record for the article: Comparative survival analysis of multiparametric tests -when molecular tests disagree- A TEAM Pathology study

2021· other· en· W6920882686 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2021
Typeother
Langueen
Domaine
Thématique
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMetadataExemestaneBiobankData sharingPopulationSubject (documents)Breast cancerClinical trialTable (database)Disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<b>Summary</b><br> This metadata record provides details of the data supporting the claims of the related article: “Comparative survival analysis of multiparametric tests -when molecular tests disagree- A TEAM Pathology study”. The related study developed a method to compare signatures using a combined quantitative mRNA array covering key molecular signatures, trained against the results of the same signatures measured by original methodology. Type of data: Nanostring data files Subject of data: <i>Homo sapiens</i> Sample size: 3811 Population characteristics: patients with centrally confirmed estrogen receptor positive (ER+ve) HER2 negative (HER2-ve) disease Recruitment: Patient samples were derived from the Tamoxifen Exemestane Adjuvant Multicenter (TEAM) Trial pathology study (Supplementary Table 1 of the related publication; NCT00279448/NCT0032126/NCT0036270, NTR267, UMIN C000000057) and included only hormone receptor positive, post-menopausal cancers. <b>Data access</b> The data generated and analysed as part of this study take the form of 3811 individual Nanostring data files (one per sample). These data represent part of a clinical trial and were used under license for the current study, therefore restrictions apply to their availability. The data are housed in institutional storage at The Ontario Institute for Cancer Research (OICR) and are not publicly available, but can be made available upon request subject to approval from the TEAM steering committee and after appropriate data sharing agreements have been completed. Requests for data access should be directed to the senior author (John Bartlett). <b>Corresponding author(s) for this study</b> John M.S. Bartlett, Diagnostic Development, Ontario Institute for Cancer Research, 661 University Avenue, Suite 510, Toronto, Ontario, M5G 0A3 Canada. jbartlett@oicr.on.ca.<br> <br> <b></b> <b>Study approval </b> Patients provided informed consent and this study was approved by the University of Toronto REB (protocol number 29021).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,451
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,006
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1250,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,156
Tête enseignante GPT0,387
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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