Additional file 1 of The impact of community-wide, mass drug administration on aggregation of soil-transmitted helminth infection in human host populations
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1: Figure S1.A. lumbricoides prevalence over time (a–c) and aggregation (parameter k) over time (d–f), in this plot we show 500 out of 1000 simulated villages. a and d: Random non-compliance; b and e: Semi-systematic non-compliance; c and f: Fully systematic non-compliance. Figure S2. Age-prevalence over time for a selected village in which elimination of A. lumbricoides infection was not achieved before mass drug administration was implemented (a) and post-MDA and one in which elimination was not achieved (b). Age groups (years): 1, 0–5; 2, 6–10; 3, 11–15; 4, 16–30; 5, 31–50; 6, 51+. Figure S3. The proportion of individuals who still harbour worms, either hookworm (a) or A. lumbricoides (b) after each round of mass drug administration (T1–5) for random compliance, semi-systematic compliance and systematic compliance. Figure S4. The proportion of individuals who harbour both male and female worms (A. lumbricoides) and produce fertile eggs (grey shaded color) and the proportion of individuals who harbour either only male or only females worms and produce no fertile eggs (orange shaded color) for random compliance (a), semi-systematic compliance (b) and systematic compliance (c). Figure S5. Results from analytical approach for predicting change in aggregation after treatment under semi-systematic non-compliance. a Comparison of mean worm burden observed from the stochastic model immediately post-treatment and that expected from the simple probability model. b Comparison of k observed from the stochastic model and that expected from the simple probability model immediately post-treatment. Note: For a, the gray line represents the equation x = y (perfect agreement).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,034 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,842 | 0,088 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».