Genetic diversity of Bradyrhizobium japonicum within soybean growing regions of the north-eastern Great Plains of North America as determined by REP-PCR and ERIC-PCR profiling
Notice bibliographique
Résumé
Abstract While soybean (Glycine max [L.] Merr.) has been grown for several decades in several northern states in the United States, the introduction of early maturing cultivars of soybean in western Canada in the late 1990’s has resulted in a exponential increase in soybean production in the region. Soybean grows in a symbiotic association with Bradyrhizobium japonicum [Kirchner] Jordan, which carries out biological nitrogen fixation within the plant roots. Previous studies have shown that rhizobia introduced from commercial inoculants tend to evolve quickly in soil. In this study, we examined the genetic diversity of 105 B. japonicum isolates from the soybean growing areas of the north-eastern Great Plains of North America by genomic fingerprinting techniques – REP-PCR and ERIC-PCR profiling. High genetic diversity was detected among the B. japonicum isolates sampled across various sites in North Dakota, South Dakota and Minnesota in the United States, and southern Manitoba in Canada. Analysis of the genetic diversity by the unweighted pair group method with an arithmetic mean algorithm (UPGMA) indicated an interesting segregation of isolates between US and Canadian sites. Results of this study also suggest a relatively rapid rate of genetic change within the B. japonicum populations and some evidence that soil texture may influence genetic diversity of the bacterium in the region.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».