MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W6922246126 · doi:10.1021/am507466b.s001

Acceleration\nof Proteolytic Activity Associated with Selection of Thiol Ligand Coatings on Quantum Dots

2016· article· en· W6922246126 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineArts and Humanities
ThématiqueLibraries and Information Services
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLigand (biochemistry)Substrate (aquarium)Context (archaeology)ProteaseThrombinNanoparticleProteasesThiol

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nanoparticle bioconjugates are attractive\nprobes for measuring the activity of hydrolytic enzymes. In these\nconfigurations, the localization of multiple copies of a hydrolase\nsubstrate to a nanoparticle scaffold has been reported to enhance\napparent activity by factors of 2 to 3 compared to that for equivalent\namounts of substrate in bulk solution. Here, we studied the effect\nof surface chemistry on protease activity using multivalent QD–peptide\nsubstrate conjugates as a model system. QDs were coated with cysteine\n(CYS), glutathione (GSH), dihydrolipoic acid (DHLA), or 3-mercaptopropionic\nacid (MPA) ligands, and thrombin and trypsin were used as model proteases.\nProteolytic activity was measured for different combinations of ligand\nand protease using Förster resonance energy transfer (FRET)-based\nassays. The highest levels of activity were observed with CYS and\nGSH coatings, and the lowest levels of activity were observed with\nDHLA and MPA coatings. In all cases, proteolytic activity was accelerated\ncompared to that for an equivalent amount of substrate in bulk solution,\nwith up to 80- and 65-fold increases in the apparent specificity constants\nfor thrombin and trypsin, respectively. Thrombin was more strongly\naffected by the QD surface chemistry, with up to a 50-fold variation\nin its apparent specificity constant between ligand coatings, whereas\nonly a 5-fold variation was observed with trypsin. These trends were\ncorrelated to adsorption of the proteases on the QDs and are discussed\nin the context of the physicochemical properties of both components.\nThis work clearly indicates a critical role for the nanoparticle interface\nin mediating substrate turnover and provides some of the strongest\nsupport to date for a so-called hopping model of activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,420
Score d'incertitude au seuil0,925

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0760,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,163 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFigshareMême sujetLibraries and Information ServicesTravaux en français237 207