Characterization of novel stripe rust resistance in wheat relatives
Notice bibliographique
Résumé
Stripe rust of wheat is one of the most damaging wheat diseases, causing on average 2% yield losses every year around the world. Through plant breeding, resistant cultivars can be generated, which renders the use of fungicides obsolete, making it a durable and environmentally friendly way to control this disease. Due to the fast-evolving nature of the causal pathogen, Puccinia striiformis f. sp. tritici, genes conferring resistance to stripe rust are often defeated following years of deployment in a certain agroecosystem, and new sources of resistance are continuously required to limit the yield losses due to stripe rust. Here, I turned to two bread wheat relatives, Aegilops tauschii and spelt wheat (Triticum aestivum subsp. spelta) for novel sources of stripe rust resistance genes. The identification of two spelt wheat cultivars resistant to stripe rust, ‘CDC Silex’ and ‘10Spelt17’ motivated efforts to identify the genetic region responsible for resistance, and for the introgression of this resistance in Canadian Western Red Spring wheat cultivars. Through the phenotyping of multiple bi-parental mapping populations, I showed that the resistance in both ‘CDC Silex’ and ‘10Spelt17’ is the same or allelic and is conferred by two complementary dominant genes. Efforts to map the region conferring resistance through BSA-seq was unsuccessful, potentially due to the small segregating population phenotyped in this study. Additionally, I showed that the resistance in both resistant spelt cultivars was silenced when transferred to a bread wheat background, through the phenotyping of F₁, F₂, F₂∶₃, and F₅ bi-parental individuals. Additionally, we identified two stripe rust resistance genes and one QTL conferring resistance to stripe rust at the seedling stage in an Aegilops tauschii diversity panel. One gene, previously cloned and identified as YrAS2388, conferred non-race specific resistance to all tested isolates, representative of the global Pst population. This gene was introgressed into a CWRS wheat genetic background through the use of Kompetitive Allele-Specific PCR (KASP) markers developed as part of this study. An additional gene, temporally named YrW057, and a QTL on chromosome 6D, conferred race specific resistance to stripe rust isolates W057 and W052, respectively.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».