Marine DOM molecular characterization using an Orbitrap Q Exactive mass spectrometer
Notice bibliographique
Résumé
The objective of this work is to study the influence of different chemical properties of DOM and inorganic nutrients on the heterotrophic basis of the planktonic food web in order to provide evidence for the hierarchy of the main factors controlling the fate of DOM in environments. coastal sailors. DOM from two contrasting environments, with similar dissolved organic carbon (DOC) concentrations, but different DOM chemical composition and nutrient availability, were incubated with two microbial communities exhibiting short-term life histories and contrasting taxonomic structures. In order to compare the influences of the chemical properties of DOM, we measured various parameters for 22 days, including (i) the concentrations and availability of inorganic and organic nutrients and carbon, (ii) changes in the elemental and molecular composition of DOM, (iii) fluorescence. properties of DOM, (iv) growth of heterotrophic prokaryotes and (v) taxonomic diversity of prokaryotes.We report our data on the molecular composition of DOM at the initial and final time points of the incubation experiments. These data were acquired by high resolution mass spectrometry (HRMS) using an Orbitrap Q Exactive mass spectrometer (Thermo Fisher Scientific) in infusion mode at the Water Quality Center (Trent University, Canada). Negative [M - H] ions were examined with a resolving power of 140,000, using a full MS scan ranging from 100 to 1000. The capillary temperature was set at 320°C and the spray voltage was maintained at 3 kV. The sheath gas pressure was 12 (arbitrary unit). The injected solution (at 10 µL.min-1) was diluted to a concentration of 10 mgC.L-1 in a mixture of MilliQ 18 MΩ water and methanol (50/50, v/v). Prior to analysis, routine mass calibration was performed with Pierce™ LTQ ESI Positive/Negative Ion Calibration Solution (88322/88324, ThermoFisher Scientific). Samples were spiked with sodium dodecyl-d25 sulfate (m/z 290.3048) and dioctylsodium sulfosuccinate (m/z 421.2265) as locking masses to ensure mass tolerance at the ppm level. Samples were taken in 1 m water depths.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».