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Enregistrement W6925235617 · doi:10.17605/osf.io/97avs

Characterization of Population Structure in Northern Bottlenose Whales (Hyperoodon ampullatus) in the North Atlantic from an Analysis of Microsatellite Data

2022· article· en· W6925235617 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueOSF Preprints (OSF Preprints) · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineSocial Sciences
ThématiqueReligious, Philosophical, and Educational Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrosatelliteGenetic structurePopulationPopulation structureCetaceaPopulation genetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objective of this analysis was to better understand northern bottlenose whale (NBW, Hyperoodon ampullatus) population structure and viability across the North Atlantic using 60 contemporary tissue specimens not available during previous genetic analyses (Feyrer et al. 2019). Tissue samples were recently collected from the Scotian Shelf, the Davis Strait – Labrador Sea, Jan Mayen near Iceland, and from a stranding in southern Newfoundland. This report focuses on results from an analysis of microsatellite data, as mitogenome assemblies were incomplete due to experimental difficulties. Among the available samples, a total of 55 unique individuals were identified by microsatellites, expanding the current genetic dataset of NBW specimens to 218 individuals collected between 1967-2019. Population structure analyses of all samples were consistent with previous reports of site fidelity, where individuals resampled at different time periods were found to have remained in the same geographic region. We detected a low number of unique microsatellite alleles in contemporary samples (2017-2019, n = 29) from the Davis Strait – Labrador Sea relative to historical samples (1971, n = 78), consistent with population reductions due to harvesting and genetic drift. In contrast, more unique alleles were detected in contemporary samples from Iceland (2014-2016, n = 26) than in historical samples from 1967 (n = 7), but this may be due to the difference in sample sizes. Analyses of population structure supported three distinct genetic groups residing in separate geographic locations: the Scotian Shelf, the northwest Atlantic (Davis Strait – Labrador Sea) and West Iceland (1967), and East Iceland (2014-2016). The differentiation of contemporary Eastern Icelandic samples from other regions has not yet been reported in the literature due to the low number of modern samples available from this region, highlighting the importance of adequate sample sizes and distribution to detect subtle population structure in NBW using microsatellites.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,169
Score d'incertitude au seuil0,994

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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