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Enregistrement W6929456317 · doi:10.5061/dryad.5k5k0

Data from: Linking innate immunogenetic variation with phenotypic traits in a wild population of tree swallows, Tachycineta bicolor

2017· dataset· en· W6929456317 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueData Archiving and Networked Services (DANS) · 2017
Typedataset
Langueen
DomaineHealth Professions
ThématiqueGlobal Health and Epidemiology
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFledgePopulationGenetic variationPhenotypeHeritabilityPhenotypic traitGeneSingle-nucleotide polymorphismReproductive success

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Unravelling the genetic basis of phenotypic variation among individuals is an important step in our understanding of evolution. Recent studies of innate immune genes, such as β -defensins, revealed that these genes had high levels of polymorphism. However, researchers have yet to quantify the effects of such variability on immune responses and fitness-related traits in wild populations. In this study, we assessed how the variability at six avian β -defensin (AvBD) genes was linked to an immune function and reproductive success in adult tree swallows (Tachycineta bicolor). We investigated the links between genetic variations using single nucleotide polymorphisms at AvBD genes, immune function as the bacterial killing ability (BKA) and fledging success. We assessed how female immunogenetics were linked to the presence of eggshell bacteria in their clutches and hatching success. We found weak associations between the presence of AvBD genes, BKA and eggshell bacteria. Our results suggested that homozygosity at some loci may be advantageous for defence against bacteria. Variability at β -defensin genes was not related to either hatching or fledging success. BKA of parents was positively linked with fledging success. More studies are needed to assess whether or not β -defensin genes are significantly affecting fitness-related traits in wild populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,049
Score d'incertitude au seuil0,097

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0180,009

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,084
Tête enseignante GPT0,400
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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