Host Proteins in Echinococcus multilocularis Metacestodes.
Notice bibliographique
Résumé
Metacestodes of Echinococcus multilocularis are the causative agents of alveolar echinococcosis, a neglected, life-threatening, zoonotic disease. To study these metacestodes in vitro, a model system using a culture medium conditioned by rat hepatoma cells is available. A key question is how the parasite interacts with the host and, in particular, which host-derived compounds are taken up. In this study, we focus on the uptake of host-derived proteins. Studies with artificially labeled proteins suggest that this uptake may occur independently of protein size or charge. Closer investigation using proteomics draws, however, a different picture. Of 1170 host (i.e., rat or bovine) proteins as identified by LC-MS/MS-based proteomics present in the culture medium, only 225 are found in metacestode vesicle tissue or fluid. Moreover, their relative abundances differ. Serum albumin, the most abundant culture medium host protein, is only the third most abundant protein in vesicle fluid, where Alpha-2-HS-glycoprotein becomes the most abundant protein. In vesicle fluid obtained ex vivo from experimentally infected mice, the situation is again different, with histone isoforms as the most abundant proteins. This suggests that while maintaining their internal milieu constant, metacestodes may adjust the spectrum of host proteins taken up. Potential uptake mechanisms and functions are discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».