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Enregistrement W6929860577 · doi:10.5061/dryad.mkkwh70w0

Data from: A revised sectional classification of Plukenetia L. (Euphorbiaceae, Acalyphoideae) with four new species from South America

2020· dataset· en· W6929860577 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research) · 2020
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensCanadian Museum of NatureUniversité de MontréalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhylogenetic treeAmazon rainforestTaxonTaxonomy (biology)Vitaceae

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract—We present a phylogenetic classification for Plukenetia (Euphorbiaceae, Acalyphoideae) based on morphology and molecular phylogenetic studies using nuclear (ETS, ITS, KEA1 introns 11 and 17, TEB exon 17) and plastid (matK, ndhF, psbA-trnH) DNA data. Plukenetia comprises 25 species divided into six sections, with three new sections and four new species described here. The circumscription of Plukenetia is unaltered from recent treatments and we continue to recognize Romanoa as distinct. The sections of Plukenetia correspond with the subclade system proposed by Cardinal-McTeague and Gillespie (2016): P1 = P. sect. Fragariopsis comb. et stat. nov.; P2 = P. sect. Penninerviae sect. nov.; P3 = P. sect. Plukenetia; P4 = P. sect. Angostylidium; and P5 = P. sect. Hedraiostylus + P. sect. Madagascarienses sect. nov. The sections are distinguished by a combination of leaf venation, staminate flower morphology, pistillate flower number, style morphology, fruit type, and seed size. Additionally, we describe three new species from South America belonging to sect. Penninerviae: Plukenetia brevistyla and Plukenetia megastyla from the Amazon basin and Plukenetia chocoensis from the Chocó Biogeographic Region of Colombia. The new Amazonian species are morphologically similar to P. brachybotrya but distinguished by their style shape and size. The new Colombian species is morphologically similar to P. penninervia but distinguished by its elongate basilaminar extrafloral nectaries, presence of abaxial laminar extrafloral nectaries, and longer inflorescences. We also describe a new species from sect. Plukenetia, Plukenetia sylvestris, which is found in central and southern Peru. This species is suggested to be the wild progenitor of the cultivated P. carolis-vegae, differing by its smaller seeds/fruits and fewer stamens. Molecular data, including a new ETS phylogeny sampling P. brevistyla, support our new taxa as distinct. Keys to the sections and species of Plukenetia are provided and we designate 12 new lectotypes for Plukenetia and Romanoa.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0040,004
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,084
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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