SystemsBioinformatics/cbmpy: CBMPy release 0.8.8
Notice bibliographique
Résumé
Release 0.8.8 Intermediate release that includes bug fixes, code cleanup and new features to support endPoint FBA. Has alpha support for Flux Balance Constraints V3 features including quadratic objectives, non-stoichiometric user constraints and KeyValue pairs. Try the latest format with cbmpy.writeSBML3FBCV3. Many thanks to Steven Wijnen for his debugging, testing and help with the QP, constraints and FBCV3 implementation. This release supports his dcFBA/endPointFBA https://github.com/SystemsBioinformatics/dynamic-community-fba package . See https://systemsbioinformatics.github.io/cbmpy/ and the README.md for more details. Install This version is only available from PyPI, install using: pip install cbmpy What's Changed start 0.8.5 by @bgoli in https://github.com/SystemsBioinformatics/cbmpy/pull/53 merge base updates to dev by @bgoli in https://github.com/SystemsBioinformatics/cbmpy/pull/54 Merge pull request #54 from SystemsBioinformatics/master by @bgoli in https://github.com/SystemsBioinformatics/cbmpy/pull/55 branch swap commands by @bgoli in https://github.com/SystemsBioinformatics/cbmpy/pull/56 updated actions by @bgoli in https://github.com/SystemsBioinformatics/cbmpy/pull/57 Add support for FBCv3 by @bgoli in https://github.com/SystemsBioinformatics/cbmpy/pull/58 CBMPy 0.8.7 dev merge by @bgoli in https://github.com/SystemsBioinformatics/cbmpy/pull/60 Full Changelog: https://github.com/SystemsBioinformatics/cbmpy/compare/0.8.4...0.8.8
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».