The Pan-Canadian Chemical Library: A Mechanism to Open Academic Chemistry to High-Throughput Virtual Screening
Notice bibliographique
Résumé
Pan-Canadian Chemical Library This Zenodo repository contains the cheap and druglike subset of the Pan-Canadian Chemical Library (PCCL) project. For more information, visit https://pccl.thesgc.org. PCCL library The PCCL library is splitted by reaction, then by number of heavy atoms. Two types of files are available in zip archives: The SMILES format files, with the SMILES string and their product name, The CSV format file, with all the information generated during their enumeration: reagents, druglike properties, etc. Note: Purchasability is defined according to two integers: 1 for products only composed of BB-50 reagents, and 2 for products composed of BB-40 or BB-50 reagents. Read more about the meaning of these reagents groups in the article below. Citation If you find the PCCL useful or if you use it, please cite our paper: Bedart, C. et al. The Pan-Canadian Chemical Library: A mechanism to open academic chemistry to high-throughput virtual screening. Scientific Data 11, (2024).doi: 10.1038/s41597-024-03443-5
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,012 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,007 | 0,020 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,005 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,008 | 0,006 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,064 | 0,065 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».