Notice bibliographique
Résumé
Please cite: Wei Shen*, Botond Sipos, and Liuyang Zhao. 2024. SeqKit2: A Swiss Army Knife for Sequence and Alignment Processing. iMeta e191. doi:10.1002/imt2.191. Wei Shen, Shuai Le, Yan Li*, and Fuquan Hu*. SeqKit: a cross-platform and ultrafast toolkit for FASTA/Q file manipulation. PLOS ONE. doi:10.1371/journal.pone.0163962. Changes SeqKit v2.8.2 - 2024-05-17 seqkit amplicon: Fix a big introduced in v2.7.0. When more than one pairs of primers are given, only the last one is used. #457 seqkit translate: Add option -e/--skip-translate-errors to skip translate error and output empty sequence. #458 seqkit split: Add flag -I/--ignore-case for -i/--by-id. #462 Links OS |Arch |File, 中国镜像 |Download Count :------|:---------|:------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------|:----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Linux |32-bit |seqkit_linux_386.tar.gz, 中国镜像 | Linux |64-bit|seqkit_linux_amd64.tar.gz, 中国镜像 | Linux |arm64 |seqkit_linux_arm64.tar.gz, 中国镜像 | macOS |64-bit|seqkit_darwin_amd64.tar.gz, 中国镜像 | macOS |arm64 |seqkit_darwin_arm64.tar.gz, 中国镜像 | Windows|32-bit |seqkit_windows_386.exe.tar.gz, 中国镜像 | Windows|64-bit|seqkit_windows_amd64.exe.tar.gz, 中国镜像| Notes please open an issuse to request binaries for other platforms. run seqkit version to check update !!! run seqkit genautocomplete to update shell autocompletion script !!!
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,012 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,005 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,004 | 0,004 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,004 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,007 | 0,005 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,006 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,281 | 0,424 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».