Computation-Ready Experimental Metal-Organic Framework (CoRE MOF) 2024 Dataset
Notice bibliographique
Résumé
The dataset is the public version of the CoRE MOF database updated in 2024 which includes 12,499 (out of 17,202) computation-ready and 13,125 (out of 23,635) not computation-ready MOF CIF files and precomputed material properties. The dataset includes structures reported up to early 2024. Precomputed properties: pore limiting diameter (PLD), largest cavity diameter (LCD), pore volume (PV), framework dimensions, accessible surface area, crystal density, topology, open metal site, MOFidv1, MOFidv2, DDEC06 partial atomic charges from PACMAN model, heat capacity, decomposition temperature, probability of solvent removal stability, probability of water stability, hydrophobic classification based on GEMC Dataset Directory Organization 1. CoREMOF2024DB_public.zip: dataset with computation-ready (CR) and not-computation ready (NCR) classifications CR dataset: 12,499 ASR (all solvent removed): 6,963 FSR (free solvent removed): 4,978 Ion (with ions): 710 NCR dataset: 13,125 Both Chen_Manz and mofchecker: 7,360 Chen_Manz: 1,565 mofchecker: 4,053 occupancy of a single atom is less than 1: 146 MOSAEC: 1 2. NCR_ASR_detail.xlsx, NCR_FSR_detail.xlsx, NCR_Ion_detail.xlsx: Details of NCR classification of all MOFs based on mofchecker and Chen_Manz method 3.ASR_data_20241125_internal.csv, FSR_data_20241125_internal.csv, ION_data_20241125_internal.csv: pore limiting diameter (PLD), largest cavity diameter (LCD), pore volume (PV), framework dimensions, accessible surface area, crystal density, topology, open metal site, MOFidv1, MOFidv2, DDEC06 partial atomic charges from PACMAN model, heat capacity, decomposition temperature, probability of solvent removal stability, probability of water stability, henry's coefficient classification of hydrophobicity, etc 4. unmodified4NCR.xlsx List of unmodified NCR structures (internal version) 5. mofid-v2.zip: XYZ files of linkers and metal nodes, errors (which is an "unknown" MOFid) 6. water.zip GEMC water isotherm data of CR dataset 7. TSA.zip Single isotherms of 35 MOFs used in TSA; TSA results and adsorption data at different feed conditions
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,004 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,008 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,004 | 0,004 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,100 | 0,087 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».