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Enregistrement W6930946267 · doi:10.5281/zenodo.2566511

bids-standard/pybids: 0.8.0

2019· other· en· W6930946267 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2019
Typeother
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCongenital Anomalies and Fetal Surgery
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and HospitalConcordia UniversityMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSearch engine indexingScope (computer science)Argument (complex analysis)InitializationCore (optical fiber)Path (computing)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Release notes Version 0.8 refactors much of the layout module. It drops the grabbit dependency, overhauls the file indexing process, and features a number of other improvements. However, changes to the public API are very minimal, and in the vast majority of cases, 0.8 should be a drop-in replacement for 0.7.*. API-breaking changes Changes to (rarely-used) BIDSLayout initialization arguments: include and exclude have been replaced with ignore and force_index. Paths passed to ignore will be ignored from indexing; paths passed to force_index will be forcibly indexed even if they are otherwise BIDS-non-compliant. force_index takes precedence over ignore. Most querying/selection methods add a new scope argument that controls scope of querying (e.g., 'raw', 'derivatives', 'all', etc.). In some cases this replaces the more limited derivatives argument. No more domains: with the grabbit removal (see below), the notion of a 'domain' has been removed. This should impact few users, but those who need to restrict indexing or querying to specific parts of a BIDS project should be able to use the scope argument more effectively. Other changes FIX: Path indexing issues in get_file() (#379) FIX: Duplicate file returns under certain conditions (#350) FIX: Pass new variable args as kwargs in split() (#386) @effigies TEST: Update naming conventions for synthetic dataset (#385) @effigies REF: The grabbit package is no longer a dependency; as a result, much of the functionality from grabbit has been ported over to pybids. REF: Required functionality from six and inflect is now bundled with pybids in bids.external, minimizing external dependencies. REF: Core modules have been reorganized. Key data structures and containers (e.g., BIDSFile, Entity, etc.) are now in a new bids.layout.core module. REF: A new Config class has been introduced to house the information found in bids.json and other layout configuration files. REF: The file-indexing process has been completely refactored. A new hierarchy of BIDSNode objects has been introduced. While this has no real impact on the public API, and isn't really intended for public consumption yet, it will in future make it easier for users to work with BIDS projects in a tree-like way, while also laying the basis for a more sensible approach to reading and accessing associated BIDS data (e.g., .tsv files). MNT: All invocations of pd.read_table have been replaced with read_csv.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,031
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: Logiciel
Score de désaccord entre enseignants0,657
Score d'incertitude au seuil0,937

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,031
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,007
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0100,014
Science ouverte0,0120,009
Intégrité de la recherche0,0040,008
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,3430,467

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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