Code to produce figures in "Satellite-derived global-ocean phytoplankton phenology indices"
Notice bibliographique
Résumé
This is the first public release of python code used to produce figures for "Satellite-derived global-ocean phytoplankton phenology indices" (Nicholson et al. 2025). The global phytoplankton phenology dataset produced using OC-CCI chlorophyll-a data includes bloom initiation, termination, and duration for three different methods: threshold (TS), cumulative threshold (CS), and rate of change (RC). Products are provided at 25 km, 9 km, and 4 km spatial resolution. All methods and processing are described in the companion paper (Nicholson et al., 2025, https://doi.org/10.5194/essd-2024-21). Data Sources: The dataset is published in the Zenodo repository under the following DOIs, 4 km: https://doi.org/10.5281/zenodo.8402932, 9 km: https://doi.org/10.5281/zenodo.8402847 and 25 km: https://doi.org/10.5281/zenodo.8402823 (Nicholson et al., 2023a, b, c). For more information, see the README and associated documentation. License: Code: MIT License Data: CC BY 4.0
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,224 | 0,241 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».