MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W6931483350 · doi:10.5281/zenodo.6361858

Correction of brain shift with Intraoperative Ultrasound - segmentation challenge

2022· article· en· W6931483350 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research) · 2022
Typearticle
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueChild Therapy and Development
Établissements canadiensConcordia University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSegmentationNeuronavigationIntraoperative MRINeuroradiologyImage registrationBrain tumorNeurosurgeryRobustness (evolution)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Early brain tumor resection can effectively improve the patient’s survival rate (Jakola et al. 2012). The proposed challenge intends to solve key issue in ultrasound-guided brain tumor resection, which is to outline the tumor boundary in intra-operative ultrasound. The tumor segmentation will (1) assist the surgeon in image interpretation, especially after brain shift has occurred and the MRI is no longer reliable and (2) segmented structures could be used to drive registration algorithms to compensate for brain shift. <br> Intra-operative ultrasound (iUS) is a robust and relatively inexpensive technique to track intra-operative tissue shift and surgical tools. Automatic algorithms for brain tissue segmentation in iUS, especially brain tumors and resection cavity can greatly facilitate the robustness and accuracy of brain shift correction through image registration, and allow easy interpretation of the iUS. This has the potential to improve surgical outcomes and patient survival rate (Xiao et al. 2020). <br> The challenge is an extension to the previous CuRIOUS 2018&amp;2019 Challenge that focused on image registration algorithms. It will provide a snapshot of the current and new techniques for iUS segmentation which may further enhance the usefulness of ultrasound in surgical guidance by assisting the neurosurgeon in ultrasound image interpretation as well as input to image registration algorithms. The challenge will provide the opportunity to benchmark the methods on the newly released dataset of iUS brain tumor and resection cavity segmentation. <strong>References</strong> Jakola et al. 2012: Comparison of a strategy favoring early surgical resection vs a strategy favoring watchful waiting<br> in low-grade gliomas. JAMA, 2012<br> Gerard et al. 2017: Brain shift in neuronavigation of brain tumors: A review, Medical Image Analysis, 2017.<br> Munkvold et al. 2017: Tumor volume assessment in low-grade gliomas: A comparison of preoperative magnetic<br> resonance imaging to coregistered 3-dimensional ultrasound recordings, Neurosurgery, Aug 2017.<br> Xiao et al. 2017: Retrospective evaluation of cerebral Tumors (RESECT): A clinical database of pre-operative MRI<br> and intra-operative ultrasound in low-grade glioma surgeries, Medical Physics, Apr. 2017<br> Maier-Hein et al. 2018: Why rankings of biomedical image analysis competitions should be interpreted with care,<br> Nature Communications, 2018<br> Xiao et al. 2020: Evaluation of MRI to Ultrasound Registration Methods for Brain Shift Correction: The CuRIOUS<br> 2018 Challenge, IEEE TMI, 2020<br> Wiesenfarth et al. 2021: Methods and open-source toolkit for analyzing and visualizing challenge results, Scientific<br> reports, 2021<br> Carton et al. (2020): Automatic segmentation of brain tumor resections in intraoperative ultrasound images using<br> U-Net, Journal of Medical Imaging 7(3); doi: 10.1117/1.JMI.7.3.031503].

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,566
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0680,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research)Même sujetChild Therapy and DevelopmentTravaux en français237 207