Data from: Population genetics and speciation of yellow-bellied, red-naped, and red-breasted sapsuckers (Sphyrapicus varius, S. nuchalis, and S. ruber)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The root of understanding speciation lies in determining the forces which drive it. In many closely-related species, including Sphyrapicus varius, S. nuchalis, and S. ruber, it is assumed that speciation occurred due to isolation in multiple Pleistocene refugia. We used genetic data from 457 samples at the control region, COI, and CHD1Z to examine rangewide population genetic structure and differentiation amongst these three species across each species’ breeding range. In addition, we modelled these species’ ecological niches for the Holocene (~6,000 ya), Last Glacial Maximum (~22,000 ya), and Last Interglacial (~120,000-140,000 ya) to determine if Pleistocene glaciations could have contributed to allopatric distributions, therefore allowing these groups to differentiate. Population genetic data show a potential Pleistocene refugium in Haida Gwaii, an east-west split among S. varius, and low genetic differentiation within each species. Our control region data show some polyphyly, while COI and CHD1Z data show differentiation among species using composite genotypes. Ecological Niche Modelling shows a large amount of niche overlap at each time period suggesting that S. varius, S. nuchalis, and S. ruber may not have been completely allopatric, and these species likely had repeated intermittent contact. Our data support the growing body of research that suggests differentiation despite gene flow.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,018 | 0,006 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».