Crustacean zooplankton and macroinvertebrate traditional taxonomy abundance data and whole community COI eDNA metabarcoding data from 13 high elevation Rocky Mountain lakes [Canada, 2018]
Notice bibliographique
Résumé
Crustacean zooplankton, macroinvertebrates and eDNA (water filtration) samples were collected from 13 high elevation mountain lakes along a range of elevation and exotic brook trout abundance in the fall of 2018 in the Rocky Mountains, Canada. Traditional enumeration methods were performed on the zooplankton samples to the species level, and macroinvertebrate samples to the family level to obtain community abundance data. eDNA samples were sequenced using cytochrome c oxidase subunit I (COI) mitochondrial gene region. Sequences were assigned to ASVs. ASVs were analysed using sequences aligned to zooplankton, macroinvertebrates and whole community separately. In addition, 15 environmental variables were used to capture abiotic variation between lakes. The data files include the traditional abundance data, the ASV sequences, taxonomic assignments of sequences and site environmental data. We used this data to validate the known community patterns of zooplankton and macroinvertebrate communities known to occur in this system and then examine if eDNA metabarcoding using COI could detect these same patterns. We also evaluated long term impact of brook trout abundance on those communities along an elevation gradient.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,005 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».