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Enregistrement W6939173242 · doi:10.60692/6trs7-h9p27

New World geometrid moths (Lepidoptera: Geometridae): Molecular phylogeny, biogeography, taxonomic updates and description of 11 new tribes

2019· article· en· W6939173242 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueGreater South Information System · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLepidoptera: Biology and Taxonomy
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTribeMonophylyTaxonPhylogenetic treeMolecular phylogeneticsNearctic ecozoneTaxonomy (biology)Genus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We analysed a molecular dataset of 1206 Geometroidea terminal taxa. In this paper we focus on New World taxa, with 102 Nearctic terminal taxa (97 of which have not previously been subject to molecular phylogenetic analysis) and 398 Neotropical terminal taxa (375 not previously analysed). Up to eleven molecular markers per specimen were included: one mitochondrial (COI) and ten proteincoding nuclear gene regions (Wingless, ArgK, MDH, RpS5, GAPDH, IDH, Ca-ATPase, Nex9, EF-1alpha, CAD). The data were analysed using maximum likelihood approach as implemented in IQ-TREE and RAxML. Photographs of almost all voucher specimens are provided together with relevant type material in illustrated electronic catalogues in order to make identities and taxonomic changes transparent. Our analysis concentrates on the level of tribes and genera, many of which are shown to be para-or polyphyletic. In an effort towards a natural system of monophyletic taxa, we propose taxonomic changes: We establish 11 new tribe names (Larentiinae, authors Brehm, Murillo-Ramos & Ounap): Brabirodini new tribe, Chrismopterygini new tribe, Psaliodini new tribe, Pterocyphini new tribe, Rhinurini new tribe, Ennadini new tribe, Cophocerotini new tribe, Erebochlorini new tribe; (Ennominae, authors Brehm, Murillo-Ramos & Sihvonen): Euangeronini new tribe, Oenoptilini new tribe, Pyriniini new tribe. We assign 27 genera for the first time to a tribe, propose 29 new tribe assignments and 26 new generic combinations, we synonymize one tribe and seven genera, revive one tribe, and propose to exclude 119 species from non-monophyletic genera (incertae sedis). Our study provides the data and foundation for numerous future taxonomic revisions of New World geometrid moths. We also examine broad-scale biogeographic patterns of New World Geometridae: While Nearctic species are often nested within the predominantly Neotropical clades, the austral South American fauna forms distinct clades, hinting at a long isolation from the remaining New World fauna. (Less)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,188
Écart entre enseignants0,174 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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