Particularities of data mining in medicine: lessons learned from patient medical time series data analysis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Nowadays, large amounts of data are generated in the medical domain. Various physiological signals generated from different organs can be recorded to extract interesting information about patients' health. The analysis of physiological signals is a hard task that requires the use of specific approaches such as the Knowledge Discovery in Databases process. The application of such process in the domain of medicine has a series of implications and difficulties, especially regarding the application of data mining techniques to data, mainly time series, gathered from medical examinations of patients. The goal of this paper is to describe the lessons learned and the experience gathered by the authors applying data mining techniques to real medical patient data including time series. In this research, we carried out an exhaustive case study working on data from two medical fields: stabilometry (15 professional basketball players, 18 elite ice skaters) and electroencephalography (100 healthy patients, 100 epileptic patients). We applied a previously proposed knowledge discovery framework for classification purpose obtaining good results in terms of classification accuracy (greater than 99% in both fields). The good results obtained in our research are the groundwork for the lessons learned and recommendations made in this position paper that intends to be a guide for experts who have to face similar medical data mining projects.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».