Genome-wide association study of pediatric obsessive-compulsive traits: shared genetic risk between traits and disorder
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Using a novel trait-based measure, we examined genetic variants associated with obsessive-compulsive (OC) traits and tested whether OC traits and obsessive-compulsive disorder (OCD) shared genetic risk. We conducted a genome-wide association analysis (GWAS) of OC traits using the Toronto Obsessive-Compulsive Scale (TOCS) in 5018 unrelated Caucasian children and adolescents from the community (Spit for Science sample). We tested the hypothesis that genetic variants associated with OC traits from the community would be associated with clinical OCD using a meta-analysis of all currently available OCD cases. Shared genetic risk was examined between OC traits and OCD in the respective samples using polygenic risk score and genetic correlation analyses. A locus tagged by rs7856850 in an intron of PTPRD (protein tyrosine phosphatase δ) was significantly associated with OC traits at the genome-wide significance level ( p = 2.48 × 10 −8 ). rs7856850 was also associated with OCD in a meta-analysis of OCD case/control genome-wide datasets ( p = 0.0069). The direction of effect was the same as in the community sample. Polygenic risk scores from OC traits were significantly associated with OCD in case/control datasets and vice versa ( p 's < 0.01). OC traits were highly, but not significantly, genetically correlated with OCD ( r g = 0.71, p = 0.062). We report the first validated genome-wide significant variant for OC traits in PTPRD , downstream of the most significant locus in a previous OCD GWAS. OC traits measured in the community sample shared genetic risk with OCD case/control status. Our results demonstrate the feasibility and power of using trait-based approaches in community samples for genetic discovery.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».