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Enregistrement W6939818079 · doi:10.6084/m9.figshare.20013022.v1

Additional file 1 of Prohibitin 1 interacts with p53 in the regulation of mitochondrial dynamics and chemoresistance in gynecologic cancers

2022· article· en· W6939818079 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensUniversity of OttawaCentre Hospitalier de l’Université de MontréalOttawa Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProhibitinApoptosisDAPICellProgrammed cell deathCancer cellCell culture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Additional file 1 Figure S1. Protein-protein interaction analysis by PLA. Control of OVCA and CECA cell and description of Duo link PLA count method. (A) A2780s (ovarian cancer cells- OVCA), (B) C13 (cervical cancer cells – CECA), and (C) human ovarian tumour section without treatment of PLA reagents (contro. Blue represents DAPI (nucleus marker) and green represents TOM20 (mitochondria marker). (D) OV2008 cells treated without (CTL) or with CDDP were subjected to PLA assay. Using Duolink image tool, white dots (PLA signal) were counted either in mitochondria (green) or nucleus (Blue). Cell number was automatically assigned as shown by Duolink image tool. (E) PLA signal in each cell were counted, summed and averaged by number of cells as shown in table. Figure S2. CDDP increased Phb1 content and apoptosis in OV2008 cells, but not in C13* cells. (A) and (B) Comparison of Phb1 contents and apoptosis in OV2008 and C13* cultured with CDDP at different concentrations (A: 0–10 μM, 24 h) or for different duration (B: 0–24 h, 10 μM). Contents of Phb1 and GAPDH (loading control) were examined by Western blotting. Apoptosis was examined by Hoechst assay. Phb1 contents in OV2008 cells but not in C13* cells were significantly increased in the presence of CDDP in a concentration- (A; **p < 0.01 ***p < 0.001, n = 3) and time- (B; ***p < 0.001, n = 3) dependent manner. OV2008 cells exhibited higher apoptosis than C13* cells when treated with CDDP. Results are expressed as mean ± SEM (n = 3) and analyzed by 2-way ANOVA and Bonferroni post-hoc test. [**p < 0.01, ***p < 0.001, (versus CDDP = 0; A) and (versus time = 0; B); n = 3]. Figure S3. p-p53 (ser15) interacts with Phb1 and Bak in response to CDDP in chemosensitive CECA cells, but not in chemoresistant cells. (A) OV2008 and C13* cells were treated with CDDP (0–10 μM, 6 h). Protein contents of Phb1, p-p53 (ser15), p-p53 (ser20), Bak and GAPDH were examined by Western blot. Protein-protein interaction was determined by IP-Western. (B) Cell lysates were immunoprecipitated with IgG (control; lanes 1) or Bak antibody. Bak immunoprecipitates were immunoblotted [IP: anti-Bak, WB: anti-Bak, −Phb1, −p-p53 (ser15 and ser20)]. Results show representative images from 3 independent experiments. Results are expressed as mean ± SEM (n = 3) and analyzed by 2-way ANOVA and Bonferroni post-hoc test. [A and B; **p < 0.01, ***p < 0.001 (compared to DMSO), n = 3]. Figure S4. Prolonged CDDP treatment induced mitochondrial localization of Phb1 in CECA cells. (A) OV2008 and (B) C13* CECA cells were cultured with CDDP (0, 10 μM, 0, 3, 6, and 24 h; DMSO as a vehicle), and were examined by confocal microscopy. Cellular localization of Phb1 (Red) and p-p53 (ser15) were shown in representative images. Green: Mitochondrial Marker and Blue: Nucleus marker (DAPI) Merge 1 indicates the merged image between Phb1 and p-p53 (ser15) whereas merge 2 indicates merged image between DAPI and Phb1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,020
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,117
Score d'incertitude au seuil0,167

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,020
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,8830,156

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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