Additional file 1 of Variability in newborn telomere length is explained by inheritance and intrauterine environment
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1: Figure S1. DNA quality analysis by agarose gel electrophoresis. Figure S2. Flowchart of sample selection and analysis steps. Figure S3. Trans-ethnic genome-wide association studies on telomere length. Figure S4. Boxplots of the top six genetic variants. Figure S5. Effect allele frequencies of the top six genetic variants. Figure S6. Heat map of pairwise Pearson correlation coefficients between clinical variables. Figure S7. Significant sex-specific effects of the selected factors on newborn telomere length. Figure S8. Association between maternal telomere length and antenatal maternal factors. Figure S9. The variance percentage explained by each factor. Figure S10. Scatter plot of average relative telomere length of cord blood and cord tissue. Figure S11. Mediation analysis of maternal telomere length. Table S1. Intra-class correlation coefficient of intra-assay and inter-assay for telomere length measurements. Table S2. Comparison of the basic characteristics of 950 subjects and the full cohort. Table S3. Clinical characteristics of maternal-offspring subjects in this study and linear regression results for newborn TL. Table S4. The association of SNPs at 3q26.2 in the GWAS results of newborn and maternal telomere lengths and the meta-analysis results. Table S5. Pairwise Linkage Disequilibrium measures between the top six genetic variants. Table S6. Linear regression results between maternal telomere length and antenatal maternal factors. Table S7. The results of sensitivity analysis after adding DNA storage time and sample collection month in the best multivariate models of newborn telomere length. Table S8. The results of sensitivity analysis after further adjustment for DNA storage time and sample collection month in the association studies between maternal telomere length and antenatal maternal factors. Table S9. The genetic variants in a strong Linkage Disequilibrium with rs10936600. Table S10. The association of candidate genes in the GWAS results of newborn and maternal telomere lengths and the meta-analysis results.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,043 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,885 | 0,113 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».